פוקימונים זוהרים הם פוקימונים בעלי צבעים שונים מן הצבע הרגיל שלהם.הם נחשבים נדירים מאוד, וישנם סיכויים מעטים לפגוש בפוקימון זוהר במשחקים. הפוקימונים הזוהרים נחשפו לראשונה במשחקי הדור השני. כאשר פוקימון זוהר מופיע או יוצא מהפוכדור, מופיעים סביבו ניצנוצים. הפוקימונים הזוהרים במשחקים אינם שונים בשום דבר מהפוקימונים הרגילים מלבד הניצנוצים סביבם כשהם נכנסים לקרב, וכוכב אדום שמופיע במידע על הפוקימון. הפוקימונים הזוהרים אינם יותר חזקים, ואין שום הבדלים בינם לבין פוקימונים רגילים.

גרוקי רגיל	גרוקי זוהר

גם באנימה הופיעו פוקימונים זוהרים. חלקם לא הוזכרו כפוקימונים זוהרים, אלא נאמר עליהם שהם בעלי צבע שונה מהרגיל.

להלן רשימת הפוקימונים הזוהרים שהופיעו באנימה;

באנימה
	נוקטאול הופיע בפרק: קרב מוחות
	שאקל הופיע בפרק: תרופת הקסם
	גרידוס הופיע בפרק: צרות באגם
	מגנטון הופיע בפרק: הפסד, תיקו או ניצחון
	סוולו הופיע בפרק: קרב בשמיים
	מג'יקארפ הופיע בפרק: השופט
	דונפן ♀ הופיעה בפרק: ציפייה לדייט
	דאסטוקס ♂ הופיע בפרק: צומת דרכים
	מטאגרוס הופיע בפרק: אטריות משוטטות
	דיטו הופיע בפרק: !Dealing With a Fierce Double Ditto Drama
	אנטיי, ראיקו וסוויקון הופיעו בסרט: Zoroark: Master of Illusions
	אריאדוס הופיע בספיישל: דון – יוצאים למסע חדש!
	גולארק הופיע בסרט: Black: Victini and Reshiram
	היידראיגון הופיע בסרט: White: Victini and Zekrom
	אוניקס הופיע בפרק: !Expedition to Onix Island
	דראדיגון הופיע בפרק: !A Pokemon of a Different Color
	ג'נסקט הופיע בסרט: Genesect and the Legend Awakened
	מג'יקארפ הופיע בפרק: לדוג את המג'יקארפ המוזהב!!
	מטאגרוס הופיע בספיישל: XYS002
	הולוצ'ה הופיע בפרק: XY051
	ראיקוזה הופיע בסרט השמיני
	דרגונייר הופיע בפרק: XY109
	פאנטאמפ הופיע בפרק: XY117
	פיקאצ'ו הופיע בפרק: XY117
	גנגר הופיע בסרט ה-19
	גארדוויר הופיעה בסרט ה-19
	גרידוס הופיע בפרק: XY133
	צ'ארג'אבאג הופיע בפרק: SM041
	ויקוולט הופיע בפרק: SM041
	מימיקינס הופיע בפרק: SM073
	"בוס" (פיקאצ'ו) הופיע בפרק: SM091
	טאפו קוקו הופיע בפרק: SM100
	גאזלורד הופיע בפרק: SM140
	סיידאק הופיע בפרק: PM014
	מאג'יקארפ הופיע בפרק: PM026
	לארבסטה הופיע בפרק: PM080
	וולקארונה הופיע בפרק: PM080
	וולטורב הופיע בפרק: PM081