סיפורי צמד סינכרון הם אלמנט שמתרחש אחרי שחוקרים את המשחק. הם עוצבו כדי לתת מידע נוסף על צמדי הסינכרון עצמם.
בד"כ יש סיפור קצר שמתמקד בדמות ואפשר להריץ אותו שוב אם רוצים.
כל הסיפורים האלה זמינים כל הזמן, אך במידה וזו הפעם הראשונה שנכנסתם אליהם – אתה תקבלו בסוף 10 אבני חן (Gems).
| מאמנ/ת | פוקימון | דרישות |
| Barry | התפתחות מפיפלאפ | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Barry | התפתחות מפרינפלאפ | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Blaine | התפתחות מפוניטה | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Brawly | התפתחות ממקוהיטה | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Brendan | התפתחות מטריקו | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Brendan | התפתחות מגרובייל | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Calem | התפתחות מאספר | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Clay | התפתחות מפלפיטוד | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Dawn | התפתחות מטרטוויג | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Dawn | התפתחות מגרוטל | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Ethan | התפתחות מסינדקוויל | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Ethan | התפתחות מקווילבה | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Grant | התפתחות מאמורה | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Hilbert | התפתחות מאושאוואט | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Hilbert | התפתחות מדוואט | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Hilda | התפתחות מטפיג | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Hilda | התפתחות מפיגנייט | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Kris | התפתחות מטוטודייל | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Kris | התפתחות מקרוקרונו | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Lt. Surge | התפתחות מוולטורב | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Lyra | התפתחות מצ'יקוריטה | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Lyra | התפתחות מבייליף | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Maylene | התפתחות ממדיטייט | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Phoebe | התפתחות מדאסטקלופ | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Pryce | התפתחות מסיל | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Ramos | התפתחות מוויפינבל | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Roark | התפתחות מקרנידוס | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Rosa | התפתחות מסנייבי | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Rosa | התפתחות מסרביין | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Roxanne | התפתחות מנוספאס | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Roxie | התפתחות מווירלפיד | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Serena | התפתחות מפנקין | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
| Serena | התפתחות מברקסיין | צמד סינכרון – רמה 45 3 קריסטלי התפתחות |
| Viola | התפתחות מסורקיט | צמד סינכרון – רמה 30 5 אבני התפתחות |
